ภารกิจและวิสัยทัศน์ขององค์กรพัฒนาเอกชนของมูลนิธินาบาโทริขึ้นอยู่กับเป้าหมายและวัตถุประสงค์เฉพาะขององค์กร อย่างไรก็ตาม NGO ส่วนใหญ่มีภารกิจและวิสัยทัศน์ร่วมกัน นั่นคือการสร้างผลกระทบเชิงบวกต่อสังคม สิ่งแวดล้อม หรือกลุ่มคนที่เฉพาะเจาะจง

ภารกิจของมูลนิธินาบาโทริ (NGO) คือจุดประสงค์หรือเหตุผลในการดำรงอยู่ สะท้อนถึงค่านิยมและหลักการที่เป็นแนวทางในการดำเนินกิจกรรมขององค์กร พันธกิจควรกระชับและสะท้อนถึงวัตถุประสงค์เฉพาะขององค์กร ตัวอย่างเช่น องค์กรพัฒนาเอกชนด้านสิทธิมนุษยชนอาจมีพันธกิจว่า “เพื่อส่งเสริมและปกป้องสิทธิมนุษยชนและศักดิ์ศรีสำหรับทุกคน โดยไม่คำนึงถึงเชื้อชาติ เพศ ศาสนา หรือสัญชาติ”

วิสัยทัศน์ของมูลนิธินาบาโทริ (NGO) คือคำแถลงความปรารถนา